员工辞工工厂不付保底工资的处理结果，受以下特殊情况影响：
1、工厂因不可抗力（如自然灾害、战争等）无法按时支付的，可暂延期，不可抗力消除后须及时支付并说明，此时不构成违法拖欠，但需提供不可抗力证明。
2、劳动合同约定保底工资需满足特定条件（如全勤、完成业绩等），员工辞工当月未满足条件的，工厂可按约定不付全额，但工资不得低于当地最低工资标准。例如约定全勤保底2000元，员工出勤15天，可按实际出勤天数折算，但折算后不得低于当地最低工资标准日工资×15天。
3、员工辞工后未完成工作交接造成工厂损失的，工厂可依法从工资中扣除赔偿，但扣除后工资余额不得低于保底工资（或当地最低工资标准），若扣除后低于法定标准，须补足差额。
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员工辞工工厂不给保底工资是否违法，可依据《中华人民共和国劳动法》分析：
根据《中华人民共和国劳动法》第四十八条（2018修正版）“国家实行最低工资保障制度。最低工资标准由省级政府规定并报国务院备案，用人单位支付工资不得低于当地最低工资标准”及第五十条“工资应以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或无故拖欠”的规定：
若员工辞工前已正常提供劳动，工厂与员工约定的保底工资不低于当地最低工资标准，则约定合法有效。工厂以辞工为由拒付保底工资，属于“无故拖欠”，违反上述规定。即使双方未明确约定保底工资，工厂支付的工资也不得低于当地最低工资标准，否则同样违法。综上，工厂未按约定或法定标准支付保底工资的行为违法。
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员工辞工后工厂不给保底工资，可能面临以下法律风险：
1、行政处罚风险：员工向劳动监察部门投诉后，劳动行政部门查实拖欠的，会责令限期支付，逾期不支付的，按应付金额50%-1倍标准加付赔偿金，还可能处以罚款。
2、维权失败风险：员工若未签书面劳动合同，仅口头约定保底工资，且无法提供工资条、银行流水等证据，工厂又否认约定，员工可能因证据链不足无法通过仲裁或诉讼追回工资。
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员工辞工工厂不付保底工资是否违法，需结合具体情况判断：
若员工辞工当月正常提供了劳动，工厂不付保底工资属违法。具体情形：
1、员工已按劳动合同履行劳动义务的，工厂应支付不低于保底工资（或当地最低工资标准）的报酬。如员工当月满勤，即使辞工，工厂也须按约定保底工资发放。
2、劳动合同明确约定保底工资条款，工厂以辞工为由拒付的，违反《劳动法》第五十条“不得克扣或无故拖欠工资”的规定。
3、工厂主张员工未提供劳动而拒付的，须举证员工存在旷工、未完成任务等情形，否则仍须支付相应工资。

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